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官員表示，這項優惠是去年報稅時首次上路，當時列報此項租稅優惠的企業，共有1,398家，共減除未分配盈餘金額高達1,864億元，但實務上還是發現不少錯誤樣態。
第一種情況，在於「軟體設備」相關支出的認定，官員指出，要適用此項實質投資，原則上還是要以「購置」為前提，核認為資本支出。
去年申報案中，發現甲公司將電腦軟體更新服務費用列報此項，因非屬資本支出，被調整減列200萬元。
官員也提到，依據《營利事業所得稅查核準則》第90條規定，進貨成本當中，可能內含一部分營業稅，這些進項稅額如果已經在營業稅申報抵減過了，也不能列入未分配盈餘的抵減金額，提醒企業今年申報時，必須留意。
第二種情況，雖然投資項目合格，款項支付的時間點也很重要，官員表示，乙公司去年申報2018年度盈餘時，雖列報500萬元投資抵減，用於購置機器設備，但實際查核發現，這500萬元當中，有100萬元是前一年度預先支付的訂金，剛好不在適用抵減的三年期間內，因此遭稅局剔除。
第三種情況當中，丙公司去年的申報案中，購置了八台機器設備，列報投資支出總額1,600萬元抵減盈餘。
官員指出，但實際查核後發現，丙公司竟將其中一台設備轉送中國大陸子公司使用，因非「供自行生產」使用，所以調整減列200萬元。
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